[澎湃新闻网]中美德科学家呼吁结束各自为政,启动国际微生物组计划
继人类基因组计划之后,10月29日,中国、美国、德国的三位科学家在国际学术期刊《自然》(Nature)上撰文呼吁启动国际微生物组计划。
上海交通大学生命科学技术学院教授赵立平是文章作者之一。他告诉澎湃新闻(www.thepaper.cn),国际微生物组计划(International Microbiome Initiative, IMI)可以类比人类基因组计划,目的是集全球之力,揭开微生物世界的更多秘密。
1985年,美国科学家率先提出测序人体内30亿个碱基对(bp)基因组的计划,随后,美国、英国、法国、德国、日本和我国科学家共同参与了这一研究。历时13年,人类基因组计划(HGP)完成,其间DNA测序技术被革新,基因测序成本不断降低。
赵立平等人的文章称,人们通过分析人体表面和内部的微生物,开始认识到它们的重要性。而人们也越来越清楚的认识到,微生物提供的生态系统服务对于区域和全球的可持续发展非常重要。
文章称,两个主要因素阻碍了人类对微生物的认知。一是生命科学领域的“碎片化”,二是微生物相关研究之间缺乏协调合作。
2005年之后,国际科学界开展了至少8项人体微生物组研究计划,包括美国人体微生物组计划,加拿大微生物组研究项目,MetaHIT(欧盟和中国参与)以及日本的人体元基因组研究项目等。但这些研究计划生成的大量数据,难以被整合或者比较。原因是它们可能采用了不同的实验材料或研究方法。文章称,“缺乏协调的、不同国家各自为政的微生物组研究计划,必定会浪费研究者的精力和纳税人的金钱。”
三位科学家认为,“国际微生物组研究计划”可以很好的解决这些问题。比如,产权保护问题一直困扰着各种计划和项目的数据共享。IMI可以对解析研究数据、发表论文和申请专利非常重要的元数据(Metadata)加以整理,并控制对这些元数据的访问权,以此解决数据共享和知识产权保护纠纷。
赵立平表示,IMI主要为了达到三个目标:筹措充足的研究经费、统一的研究标准、协作整合。具体来说就是,在得到足够研究经费支持的情况下,建立一种机制,统一不同国家中不同的微生物组的研究标准,并对这些研究数据进行整合,以发现对全球生态环境和人类健康有重大影响的微生物生态过程。
来源:澎湃新闻网 2015.10.30