上海交大博士创业团队利用云平台进行基因测序和分析
王雪阳(左)指导实验人员完成提取红细胞。 郑子愚 摄
闵行区“零号湾”创新创业集聚区实验室里,实验员身着白大褂,戴专用手套和口罩,神情专注于小试管。“只需一滴血或者唾液,我们就能知道此人将来有多大风险可能得癌。”上海舜森基因科技股份有限公司董事王雪阳说。
这家利用云平台进行基因测序和分析的公司,由上海交大医学院和生物医学工程学院的两名博士生创建,4年间从最初的二人组发展为如今150余人的大团队。营业额首年50万元,今年前三季度已营收2000万元。
在首届中国“互联网+”大学生创新创业大赛总决赛中,舜森基因摘得全国银奖。
2000元“普查”个体基因
几个月前,一位呼吸科医生辗转找到舜森基因,希望对一种结核杆菌标本进行基因测序和分析。细菌感染性极强,其他公司百般推却,舜森基因则毅然接下单子。在确保安全的前提下,他们按要求完成测序分析,让客户接上后续研究。
基因研究中,测序和分析是两个步骤。由于涉及统计学、数学、计算机等专业,专攻生物与医学的研究人员即使拥有测序仪器,也可能不具备分析能力,结果导致研究卡壳。舜森针对专业人士,将由“A、G、C、T”4种碱基组成的基因序列,“翻译”成可视化的分析报告,收取相应服务费。
据了解,基因测序领域分为上、中、下游。上游提供测序仪器,几乎被国内外名企垄断;中游提供专业服务;下游涉及医疗健康应用,市场潜力巨大。研究人员只需从一个人的血样中提取红细胞,放入基因测序仪,当天就能测出这个人的基因序列。接着,计算分析并“翻译”此人基因是否存在缺陷,整个过程最快仅需2天。舜森基因将业务起初定位的中游向下游拓展。他们与大连一家体检机构合作,由机构提供体检血样,舜森将个人基因测序结果“翻译”出来,让受检者获知自己罹患肝癌、胃癌、肺癌等癌症的几率。此前,有一名女性受检人经检测发现,其患乳腺癌概率超过80%,医生建议她尽早提防。
基因测序最早每人至少要2万元,随着科学技术的进步,价格降至数千元。舜森基因采用轻资产模式——公司只配置价格较低的常用测序仪器,既满足中游的专业服务,又把下游的应用价格降至2000元,在同行中属于低价。
建基因云平台积累数据
舜森基因独立研发的软件著作权多达50项。去年10月,公司建成具备智能网络分析功能的基因云平台。研究人员将小鼠、人类乃至细菌的各种基因序列片段上传平台。如今,平台已获国家专利授权。
平台建设并不能为舜森基因带来可观利润,“但基因数据应当不断积累和共享。”王雪阳说。上传的基因序列和分析结果储存在平台中,部分数据对其他研究者公开。经过大量基因序列片段积累,平台现拥有29GB数据。王雪阳表示,经历量变过程,平台将发展为一个大数据库。此外,舜森基因还为制药单位提供基因数据支持。随着平台上基因样本量递增,特定致病基因的分析结果将越发精准,针对性研发新药的成功率和有效率有望提升。
舜森基因还将开拓一些更富“科学趣味”的基因测序和分析。比如,通过基因检测知道自己未来会不会脱发、会不会长络腮胡子、会不会容易醉酒等。此类测序的工作量较小,服务价格仅需数百元。
来源: 解放日报 2015.11.11 第11版 :科教卫体·社会
原文: 一滴血,可知患癌风险有多大